朽木氏は近江佐々木氏の一族。鎌倉時代に近江国（滋賀県）の朽木荘の地頭となり、戦国の世を生き抜き、江戸時代になってからも、旗本あるいは大名として存続しました。『朽木家古文書』は同家に伝えられた古文書で、明治21年（1888）に内閣記録局が朽木家から購入したもの。1060余通の文書から成り、平成元年（1989）に国の重要文化財に指定されました。
長禄4年(1468)になると近江国高嶋郡朽木庄(現・高島市)の一部が、将軍家の御料所となり、毎年百貫文を上納するよう命ぜられました。